Adsorbimi i sitës molekulare të zeolitit është një proces ndryshimi fizik. Arsyeja kryesore për adsorbimin është një lloj "force sipërfaqësore" e prodhuar nga graviteti molekular që vepron në sipërfaqen e ngurtë. Kur lëngu rrjedh, disa molekula në lëng përplasen me sipërfaqen e adsorbentit për shkak të lëvizjes së parregullt, duke shkaktuar përqendrim molekular në sipërfaqe. Zvogëloni numrin e molekulave të tilla në lëng për të arritur qëllimin e ndarjes dhe heqjes. Meqenëse nuk ka ndonjë ndryshim kimik në absorbim, për sa kohë që ne përpiqemi të largojmë molekulat e përqendruara në sipërfaqe, sita molekulare zeolite do të ketë përsëri kapacitet absorbues. Ky proces është procesi i kundërt i absorbimit, i quajtur analizë ose rigjenerim. Meqenëse sita molekulare e zeolitit ka një madhësi uniforme të poreve, vetëm kur diametri i dinamikës molekulare është më i vogël se sita molekulare e zeolitit, ai lehtë mund të hyjë në brendësi të zgavrës së kristalit dhe të absorbohet. Prandaj, sita molekulare zeolite është si një sitë për molekulat e gazit dhe të lëngëta, dhe përcaktohet nëse do të absorbohet apo jo sipas madhësisë së molekulës. Me Meqenëse sita molekulare zeolite ka një polaritet të fortë në zgavrën kristalore, mund të ketë një efekt të fortë në sipërfaqen e sitës molekulare të zeolitit me molekula që përmbajnë grupe polare, ose duke nxitur polarizimin e molekulave të polarizueshme për të prodhuar një absorbim të fortë. Ky lloj molekulash polare ose lehtësisht i polarizuar është i lehtë për tu absorbuar nga sita molekulare zeolite polare, e cila pasqyron një selektivitet tjetër absorbues të sitës molekulare zeolite.
Në përgjithësi, shkëmbimi i joneve i referohet shkëmbimit të kationeve të kompensimit jashtë kornizës së sitës molekulare të zeolitit. Jonet e kompensimit jashtë kornizës së sitës molekulare të zeolitit janë përgjithësisht protone dhe metale alkaline ose metale alkaline të tokës, të cilat shkëmbehen lehtësisht me jone në sitë molekulare të zeolitit të llojit jonit metalik të valencës në tretësirën ujore të kripërave metalike. Jonet janë më të lehtë për të migruar në kushte të caktuara, të tilla si tretësira ujore ose temperatura më të larta.
Në tretësirën ujore, për shkak të selektivitetit të ndryshëm të joneve të sitave molekulare të zeolitit, mund të shfaqen veti të ndryshme të shkëmbimit të joneve. Reagimi i shkëmbimit të joneve hidrotermale midis kationeve metalike dhe sitave molekulare të zeolitit është një proces i përhapjes së lirë. Shkalla e difuzionit kufizon shkallën e reagimit të këmbimit.
Sitat molekulare Zeolite kanë një strukturë unike të rregullt kristalore, secila prej të cilave ka një strukturë të poreve të një madhësie dhe forme të caktuar, dhe ka një sipërfaqe të madhe specifike. Shumica e sitave molekulare zeolite kanë qendra të forta acidi në sipërfaqe, dhe ekziston një fushë e fortë Coulomb në poret kristalore për polarizim. Këto karakteristika e bëjnë atë një katalizator të shkëlqyer. Reagimet katalitike heterogjene kryhen në katalizatorë të ngurtë, dhe aktiviteti katalitik lidhet me madhësinë e poreve kristalore të katalizatorit. Kur një sitë molekulare zeolite përdoret si katalizator ose bartës i katalizatorit, përparimi i reaksionit katalitik kontrollohet nga madhësia e poreve të sitës molekulare të zeolitit. Madhësia dhe forma e poreve dhe poreve kristalore mund të luajnë një rol selektiv në reagimin katalitik. Nën kushtet e përgjithshme të reagimit, sitat molekulare të zeolitit luajnë një rol udhëheqës në drejtimin e reagimit dhe shfaqin performancë katalitike përzgjedhëse të formës. Kjo performancë i bën sitat molekulare të zeolitit një material të ri katalitik me vitalitet të fortë.